Главный ботанический сад Академии наук СССР создан 14 апреля 1945 года.

Учредителем и собственником имущества Учреждения является Российская Федерация. Функции и полномочия учредителя Учреждения от имени Российской Федерации осуществляет Министерство науки и высшего образования Российской Федерации (Минобранауки России).

Руководитель учредителя:

Фальков Валерий Николаевич, Министр науки и высшего образования Российской Федерации

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Главный ботанический сад им. Н.В. Цицина Российской академии наук является научной организацией.